成本高 大多数农产品商品价值较低，运输成本较高，超过商品成本的100%甚至更多。4000家农产品电商，仅有1%盈利，另外的7%巨亏，88%略亏，4%持平。

　　标准不一 农产品的品种类别较多且复杂多样，因此，相应的标准不统一，难以统一定价，绿色农产品、无公害农产品、有机农产品、中国地理标产品(“三品一标”)农产品难以确定，导致货真价实的农产品难有市场。

　　安全性低 许多农产品的安全性不高，农药残留、激素残留等不安全因素还大量存在，“三品一标”产品数量及其比例较低。

　　运营环境不好 当前农产品电商市场是“寡头市场”，除了阿里系、京东系外，其他农产品零售电商主要受两大电商影响，“优质优价”农产品电商优势难以发挥，特别是“小众特色”电商难以得到正常发育。

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